MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 68375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013768	TG	3	6	13	18	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013768	A	7	7	157	163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013768	AAAT	2	8	167	174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013768	GAC	2	6	257	262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993441
5	NC_013768	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993441
6	NC_013768	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993441
7	NC_013768	ATAA	2	8	341	348	75 %	25 %	0 %	0 %	284993441
8	NC_013768	A	8	8	371	378	100 %	0 %	0 %	0 %	284993441
9	NC_013768	GAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993441
10	NC_013768	TAA	2	6	516	521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993441
11	NC_013768	CTG	2	6	546	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993441
12	NC_013768	GA	3	6	628	633	50 %	0 %	50 %	0 %	284993441
13	NC_013768	AT	3	6	637	642	50 %	50 %	0 %	0 %	284993441
14	NC_013768	AAT	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993441
15	NC_013768	TC	3	6	677	682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013768	ATATG	2	10	690	699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013768	A	6	6	745	750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013768	TAAT	2	8	820	827	50 %	50 %	0 %	0 %	284993442
19	NC_013768	A	7	7	861	867	100 %	0 %	0 %	0 %	284993442
20	NC_013768	GTC	3	9	923	931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993442
21	NC_013768	GAA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993442
22	NC_013768	T	10	10	983	992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013768	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013768	A	9	9	1053	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	284993443
25	NC_013768	A	8	8	1071	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	284993443
26	NC_013768	TGT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993443
27	NC_013768	AAG	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993443
28	NC_013768	A	7	7	1194	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	284993443
29	NC_013768	AATC	2	8	1271	1278	50 %	25 %	0 %	25 %	284993443
30	NC_013768	AT	3	6	1289	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	284993443
31	NC_013768	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993443
32	NC_013768	CGG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284993443
33	NC_013768	TGAAG	2	10	1334	1343	40 %	20 %	40 %	0 %	284993443
34	NC_013768	AGTG	2	8	1405	1412	25 %	25 %	50 %	0 %	284993443
35	NC_013768	GAA	3	9	1452	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993444
36	NC_013768	GTT	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993444
37	NC_013768	AAACA	2	10	1790	1799	80 %	0 %	0 %	20 %	284993444
38	NC_013768	ACA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993444
39	NC_013768	ATG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993444
40	NC_013768	GTT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993444
41	NC_013768	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993444
42	NC_013768	CTA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993444
43	NC_013768	TAG	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993444
44	NC_013768	CAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993444
45	NC_013768	ATTC	2	8	1940	1947	25 %	50 %	0 %	25 %	284993444
46	NC_013768	GTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993444
47	NC_013768	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993444
48	NC_013768	ATC	2	6	2019	2024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993444
49	NC_013768	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993444
50	NC_013768	AAAT	2	8	2055	2062	75 %	25 %	0 %	0 %	284993444
51	NC_013768	CAT	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993444
52	NC_013768	ATTAC	2	10	2113	2122	40 %	40 %	0 %	20 %	284993444
53	NC_013768	TGCTCT	2	12	2127	2138	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284993444
54	NC_013768	TAAT	2	8	2183	2190	50 %	50 %	0 %	0 %	284993444
55	NC_013768	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284993444
56	NC_013768	GCTG	2	8	2223	2230	0 %	25 %	50 %	25 %	284993444
57	NC_013768	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993444
58	NC_013768	A	6	6	2260	2265	100 %	0 %	0 %	0 %	284993444
59	NC_013768	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	284993444
60	NC_013768	AAGAA	2	10	2299	2308	80 %	0 %	20 %	0 %	284993444
61	NC_013768	GA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	50 %	0 %	284993444
62	NC_013768	GAA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993445
63	NC_013768	ACA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993445
64	NC_013768	A	6	6	2421	2426	100 %	0 %	0 %	0 %	284993445
65	NC_013768	AGA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993445
66	NC_013768	GATT	2	8	2498	2505	25 %	50 %	25 %	0 %	284993445
67	NC_013768	AGA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993445
68	NC_013768	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	284993445
69	NC_013768	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993445
70	NC_013768	AAC	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993445
71	NC_013768	ATT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993445
72	NC_013768	CAAA	2	8	2755	2762	75 %	0 %	0 %	25 %	284993445
73	NC_013768	GC	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	284993445
74	NC_013768	GAAA	2	8	2823	2830	75 %	0 %	25 %	0 %	284993445
75	NC_013768	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993445
76	NC_013768	AAAT	2	8	2925	2932	75 %	25 %	0 %	0 %	284993445
77	NC_013768	T	7	7	2964	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013768	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013768	GGTTC	2	10	3000	3009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013768	GAT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993446
81	NC_013768	AAGT	2	8	3053	3060	50 %	25 %	25 %	0 %	284993446
82	NC_013768	TGG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993446
83	NC_013768	ATGG	2	8	3120	3127	25 %	25 %	50 %	0 %	284993446
84	NC_013768	AGC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993446
85	NC_013768	GAA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993446
86	NC_013768	TAT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993446
87	NC_013768	CTTA	2	8	3298	3305	25 %	50 %	0 %	25 %	284993446
88	NC_013768	GAAGGA	2	12	3306	3317	50 %	0 %	50 %	0 %	284993446
89	NC_013768	AATG	2	8	3366	3373	50 %	25 %	25 %	0 %	284993446
90	NC_013768	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993446
91	NC_013768	GTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993446
92	NC_013768	GTT	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993446
93	NC_013768	T	6	6	3499	3504	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
94	NC_013768	AAGT	2	8	3557	3564	50 %	25 %	25 %	0 %	284993447
95	NC_013768	AAT	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
96	NC_013768	TGC	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993447
97	NC_013768	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
98	NC_013768	T	8	8	3686	3693	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
99	NC_013768	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
100	NC_013768	TGG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993447
101	NC_013768	GTG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993447
102	NC_013768	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993447
103	NC_013768	TGA	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993447
104	NC_013768	TTC	3	9	3916	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993447
105	NC_013768	A	6	6	3926	3931	100 %	0 %	0 %	0 %	284993447
106	NC_013768	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993447
107	NC_013768	ATA	2	6	3992	3997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
108	NC_013768	GAA	3	9	4032	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993447
109	NC_013768	T	8	8	4058	4065	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
110	NC_013768	TTG	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993447
111	NC_013768	TGA	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993447
112	NC_013768	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993447
113	NC_013768	TAAAAG	2	12	4174	4185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284993447
114	NC_013768	GTATG	2	10	4274	4283	20 %	40 %	40 %	0 %	284993447
115	NC_013768	TA	3	6	4312	4317	50 %	50 %	0 %	0 %	284993447
116	NC_013768	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993447
117	NC_013768	TAA	2	6	4348	4353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
118	NC_013768	TGC	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993447
119	NC_013768	T	6	6	4419	4424	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
120	NC_013768	T	6	6	4428	4433	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
121	NC_013768	T	6	6	4456	4461	0 %	100 %	0 %	0 %	284993447
122	NC_013768	AGG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013768	A	6	6	4620	4625	100 %	0 %	0 %	0 %	284993448
124	NC_013768	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993448
125	NC_013768	ATTT	2	8	4826	4833	25 %	75 %	0 %	0 %	284993448
126	NC_013768	ATT	2	6	4872	4877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
127	NC_013768	TTA	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
128	NC_013768	AT	3	6	4964	4969	50 %	50 %	0 %	0 %	284993448
129	NC_013768	CTTTA	2	10	5051	5060	20 %	60 %	0 %	20 %	284993448
130	NC_013768	ATT	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
131	NC_013768	ATTG	2	8	5117	5124	25 %	50 %	25 %	0 %	284993448
132	NC_013768	GAAA	2	8	5198	5205	75 %	0 %	25 %	0 %	284993448
133	NC_013768	GT	3	6	5284	5289	0 %	50 %	50 %	0 %	284993448
134	NC_013768	TAG	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993448
135	NC_013768	GGTG	2	8	5351	5358	0 %	25 %	75 %	0 %	284993448
136	NC_013768	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
137	NC_013768	CAG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993448
138	NC_013768	GTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993448
139	NC_013768	T	6	6	5472	5477	0 %	100 %	0 %	0 %	284993448
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